Структура управления МБДОУ «Детского сада № 59 «Ягодка» соответствует Закону 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации» и Уставу Учреждения. Деятельность учреждения регламентируется приказами управления дошкольного образования и Уставом Учреждения. Управление учреждением осуществляется заведующим на принципах единоначалия и самоуправления, который назначается на должность и освобождается от должности Учредителем.
Система управления представляет собой следующую структуру: